Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SPTAN1Q13813 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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