Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PMS2P11Q13670 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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