Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 BX005214.2-201ENST00000423499 1077 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDAP1Q13442 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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