Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms