Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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