Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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