Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB40BQ12829 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms