Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SPOCK1Q08629 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPOCK1Q08629 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPOCK1Q08629 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPOCK1Q08629 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPOCK1Q08629 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPOCK1Q08629 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPOCK1Q08629 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SPOCK1Q08629 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPOCK1Q08629 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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