Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms