Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms