Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms