Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLTCQ00610 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms