Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP2C1P98194 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms