Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRB1P82279 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRB1P82279 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRB1P82279 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms