Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms