Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EMP3P54852 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EMP3P54852 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EMP3P54852 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms