Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX1P48742 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LHX1P48742 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LHX1P48742 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX1P48742 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX1P48742 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX1P48742 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LHX1P48742 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms