Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD8P48556 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms