Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CAPZBP47756 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms