Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms