Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PI4KAP42356 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms