Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARL1P40616 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms