Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ETFBP38117 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ETFBP38117 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ETFBP38117 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ETFBP38117 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms