Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LTBRP36941 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBRP36941 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBRP36941 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LTBRP36941 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms