Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP214P35658 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms