Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPB2P35606 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
COPB2P35606 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPB2P35606 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPB2P35606 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPB2P35606 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPB2P35606 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPB2P35606 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms