Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD13P35453 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms