Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJA4P35212 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms