Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCKBRP32239 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms