Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HOXA7P31268 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms