Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EPHA3P29320 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms