Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTX3P26022 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTX3P26022 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTX3P26022 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTX3P26022 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTX3P26022 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms