Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMA3P25788 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA3P25788 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms