Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms