Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHCGRP22888 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms