Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD247P20963 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD247P20963 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CD247P20963 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD247P20963 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms