Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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