Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms