Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC166P0CW27 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms