Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms