Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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PKHD1P08F94 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PKHD1P08F94 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PKHD1P08F94 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PKHD1P08F94 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PKHD1P08F94 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PKHD1P08F94 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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