Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLOCKO15516 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms