Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN8O00124 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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