Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOC4-APOC2K7ER74 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms