Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms