Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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