Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAP3K4Q9Y6R4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms