Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
HECTD4Q9Y4D8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms