Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNRC6BQ9UPQ9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms