Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCDHA12Q9UN75 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms